O “Atlas of Cancer Signaling Network”, português algo como “Atlas das vias de sinalização do cancro”, foi  desenvolvido pelo Institut Curie, em Paris. Trata-se de uma base de dados, de acesso livre, que coleciona as várias vias de sinalização celular envolvidas no cancro. A base dados oferece um mapa com dados acerca de todas as interações entre proteínas e contém cerca de 4600 reações que envolvem 1821 proteínas e 565 genes.

Esta base de dados foi construída para funcionar de forma semelhante ao Google Maps, isto é, apresentando uma visão global e aumentar o detalhe sobre as vias de sinalização e as proteínas envolvidas à medida que o utilizado faça zoom no mapa.

Vamos conhecer um pouco da base de dados

A base de dados apresenta um mapa interactivo, onde podemos navegar pelas diferentes vias de sinalização, tal como faríamos num mapa geográfico do Google Maps.

Pode ainda optar por pesquisar por uma determinada entidade (proteína, reação, gene…) e ver as interações que esta estabelece com as demais proteínas da célula.

Integrar dados externos

Outra opção muito interessante, é a possibilidade de carregar informação externa que pode ser facilmente mapeada nesta base dados. Imagine que têm dados da expressão de genes e/ou proteínas de células de diferentes linhas celulares, pode optar por carregar esses dados e ver um mapa de densidade de ativação. As manchas gráficas criadas podem ser úteis para mais facilmente comprar resultados de diferentes linhas celulares, nomeadamente entre linhas celulares normais e tumorais, por exemplo.

Não só os níveis de expressão podem ser importados, mas também dados relativos a mutações podem ser carregados e visualizados nos mapas desta base de dados.

Vermelho – Genes sobre-expressos
Verde – Genes sub-expressos

Acesso à base de dados | Acesso direto ao mapa