O EnzymeX é uma aplicação gratuita para OS X que ajuda bioquímicos e biólogos moleculares a analisar longas sequências de DNA e fazer rápidas análises de restrição, contendo ainda um banco de enzimas de restrição e respectivos locais de corte.
Características
Esta aplicação tem um excelente design e foi vencedor do Apple Design Award 2006.
Ecrã de abertura
Enzimas
A aplicação contem informação de mais de 700 enzimas de restrição e ainda informação relativa aos locais de corte e ainda qual a empresa que as comercializa e os ciclos que devem ser usados quando se procede ao tratamento com essas enzimas.
Para além disso incluí informação relativa à eficiência da restrição com diferentes tampões (buffers) de mais de 15 fabricantes.
Permite facilmente determinar isoschizomers e terminações compatíveis. Adicionalmente é sensível à metilação do DNA e ainda à star activity.
Editor de DNA
Permite importar dados acerca das sequências de DNA a partir de diversos formatos, incluíndo a possibilidade de importação direta a partir do NCBI Entrez. Muito fácil para editar sequências de DNA, proceder a digestões enzimáticas virtuais e ainda tradução em proteína.
Navegação ao longo da sequência de DNA é facilitada devido à incorporação de mapas navegáveis.
Contempla ainda uma biblioteca de mais de 1000 motivos conhecidos diferentes e permite ainda que o utilizador possa adicionar os seus próprios motivos. Assim, mesmo para sequências de DNA muito grandes, é fácil procurar por diferentes motivos.
Outras ferramentas de apoio
- Digestão dupla: Determinar quais os melhores tampões (buffers) para uma digestão dupla;
- Calculadora
- Determina a composição das misturas reaccionais
- Outras ferramentas podem ser adicionadas através do uso de plugins
Esta ferramenta é usada por muitos investigadores em todo o mundo como os das instituições abaixo:
- Berkeley University
- Cancer Research UK
- Duke University
- Imperial College London
- Institut Pasteur
- University of Oxford
- Standford University
- Yale University
- …
Página Oficial | Descarregar para OS X (Gratuito)