Hoje apresento-vos uma base de dados, gratuita mas bastante detalhada, de todas as enzimas conhecidas, contando atualmente com quase 6000 entradas. Estamos a falar da base de dados ENZYME da ExPASy.
A base de dados incluí informação de nomenclatura organizada por:
- Número EC;
- Classe da Enzima;
- Descrição;
- Nome da enzima;
- Ligando;
- Cofactor.
Pesquisa por cofactor
Esta base de dados é particularmente útil quando queremos fazer uma pesquisa por todas as enzimas que usam um determinado cofactor ou que ligam uma determinada molécula.
Por exemplo, acedendo à secção “por cofactor” (“by cofactor”), temos acesso imediato a uma página como todos os cofactores que são usados pelas enzimas.
Depois pode selecionar um determinado cofactor para saber quais são as enzimas que o usam no seu processo de catálise. No exemplo abaixo, foi escolhido o Fe(II) como cofactor, resultando na seguinte lista de enzimas.
A lista incluí o nome da enzima e o respectivo número EC que abre uma nova página para informações mais detalhadas acerca dessa mesma enzima. De entre toda a informação apresentada, destacamos a apresentação da equação química que descreve a reação catalisada pela enzima e ainda uma lista de entradas para outras bases de dados que contêm outra informação relacionada, como dados cinéticos, termodinâmicos…
